酿酒酵母中蛋白质复合物的全球景观_国际

　　蛋白质 - 蛋白质相互作用的鉴定通常可以洞悉蛋白质功能，并且许多细胞过程都是通过稳定的蛋白质复合物进行的。我们使用串联亲和力纯化来处理酿酒酵母的4,562种不同标记的蛋白质。通过基质辅助激光解吸/电离 - 飞行质谱和液相色谱串联质谱法分析每种制剂，以提高覆盖率和准确性。机器学习用于整合质谱分数并将概率分配给蛋白质 - 蛋白质相互作用。在4,087种不同的蛋白质中，通过2,357种成功纯化的质谱识别高置信度，我们的核心数据集（中位数为0.69）包括7,123个蛋白质 - 蛋白质相互作用，涉及2,708蛋白。马尔可夫聚类算法将这些相互作用组织为547个蛋白质复合物，平均每个复合物中的4.9个亚基，其中大约一半来自MIPS数据库，以及429个复合物之间的其他相互作用。数据（所有这些都可以在线获得）将有助于将来对单个蛋白质以及功能基因组学和系统生物学的研究。

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