2025-06-25 03:58来源:本站
基因复制和损失是功能创新的强大来源。但是,控制这一过程的一般原则仍然在很大程度上未知。随着测序基因组数量的越来越多,现在可以以全面且公正的方式检查这些事件。在这里,我们开发了一种可以解决大量物种中所有基因的进化史的程序。我们将程序应用于17个真菌基因组,以创建一个全基因组的基因树目录,这些目录确定了这些物种之间精确的矫正和催化关系。我们表明,基因的重复和损失受到基因的功能特性和相互作用伙伴的高度限制。特别是,与压力相关的基因表现出许多重复和损失,而与生长相关的基因显示出针对这种变化的选择。全基因组重复规定了这一约束并放松二分法,从而扩大了基因复制的功能范围。通过表征重复基因的功能命运,我们表明复制基因在生化功能方面很少有所不同,但通常在调节控制方面有所不同。令人惊讶的是,即使在全基因组重复之后,基因的寄生虫模块也很少出现。相反,基因复制可以通过专业化来驱动功能网络的模块化,从而解散细胞系统。