B.1.617和其他SARS-COV-2变体的BNT162B2诱导的中和

2025-06-24 14:50来源:本站

  自2019年底出现以来,SARS-COV-2已引起超过1.74亿次感染和370万多人的死亡,这是全球Covid-19造成的(截至2021年6月9日; https://coronavirus.jhu.edu/)。尽管冠状病毒具有维持其长基因组RNAS6的校对机制,但在循环病毒中不断出现突变。由于病毒尖峰蛋白(S)与血管紧张素转换酶2(ACE2),病毒附着的细胞受体结合,并在病毒进入过程中介导膜融合,因此峰值蛋白中的突变可以改变SARS-COV-2透射,组织tropism和疾病的结果7。实际上,第一个普遍的尖峰突变D614G促进了与ACE2的峰值结合,从而增强了SARS-COV-23,8,9,10,11的传播。随后,另一个尖峰突变N501Y在几种在不同位置首次鉴定的变体中汇聚出来,包括英国(Lineage B1.1.7),巴西(Lineage p.1)和南非(Lineage b.1.351)2。N501Y突变还增加了尖峰对ACE2的亲和力,并增加了病毒传播12,13。尖峰中的某些突变,例如E484K,有助于逃避抗体中和。E484K突变已在许多变体中独立出现,例如第1卷,第1.351页,B.1.526(首次在纽约确定),B.1.525(首次在尼日利亚鉴定)和​​P3(在菲律宾首次识别)1,2,14。因此,随着共同-19大流行的继续,必须密切监测新突变或突变组合对病毒传播,发病机理和疫苗和治疗效率的影响。

  BNT162B2是一种表达SARS-COV-2的完整预融合峰糖蛋白的mRNA疫苗,对1915年的Covid-1915有效95%。美国食品药品监督管理局已授权BNT162B2在紧急使用规​​定下对12岁及以上的个人进行疫苗接种。Although the sequence of the mRNA in BNT162b2 is based on the original SARS-CoV-2 isolate16, it has previously been shown that sera from individuals immunized with BNT162b2 retained neutralizing activity against all tested variants, including the B.1.1.7, P.1, B.1.351, B.1.429, B.1.526, and B1.1.7+E484K谱系1,2,4,5,17。从那时起,印度的第二波浪潮与变体的扩展有关B.1.617.1至32个国家的扩展,B.1.617.2至49个国家,B.1.618到6个国家(截至2021年5月31日; https://cov-lineages.org/lineages.org/lineaeage/lineage/lineage/lineage/lineage/lineage/lineage/lineeage/lineage/lineage/lineage/lineage/lineage/llineage/lineage/lineage/lineage/lineage/lineage_b.b.6.6 b.618.hhh Hous)B.1.617.2变体显示了在UK18中传播特别高的证据。此外,最初在尼日利亚检测到的变体B.1.525已蔓延到49个国家。所有这些变体目前都在美国循环。世界卫生组织已将B.1.617血统指定为关注的一种变体,而B.1.525是兴趣的变体。18。这项研究分析了BNT162B2引用的中和对这些新鉴定的变体。

  为了检查变体突变对中和的影响,我们使用反向遗传系统将完全的尖峰基因从不同的变体交换为早期的SARS-COV-2分离株(USA-WA1/2020,定义为野生型)(扩展数据图1A)。我们准备了五种带有不同尖峰蛋白的嵌合病毒,如下:(1)B.1.525-Spike(带有Q52R,A67V,H69/Y70缺失(∆69/70),Y145缺失(Δ145)(∆145),E484K,e484k,d614g,d614g,Q6777H,and f.1677H,and F.888.(2)B.1.617.1尖峰(与G142D,E154K,L452R,E452R,E484Q,D614G,D614G,P618R,Q1071H,H1101D,H1101D,以及D111(核苷酸T21895C)的同义突变,来自B.1.617.617.1 variant);(3)B.1.617.2尖峰(带有T19R,G142D,L452R,T478K,D614G,D614G,P681R和D950N和D950N和D950N,b.1.617.2 variant(gisaid(gisaid)(gisaid(gisaid)(gisaid(https://wwwwwww.gisaid.org/)B.1.617.2-v2尖峰(在B.1.617.2中的突变以及额外的E156G替代和F157 – R158缺失(∆157-158)在当前循环的B.1.617.2 b.1.617.2 b.1.618-spipion and(5)b.1.618 spike(y149)中;(∆145–146),b.1.618变体的E484K和D614G产生了超过107个斑块形成单元(PFUS)的感染性滴度。对于它们的病毒RNA基因组与PFU的比率(一种表明病毒感染的参数)。

  为了比较不同变体对中和的敏感性,我们使用在Pivotal临床试验中以BTN162B2免疫的志愿者收集的20个血清的面板进行了50%的斑块减少中和(PRNT50)测试。在两次免疫中的第二次使用30μgBnt162b2的第二个免疫接种后两到四个星期,将血清标本绘制,这些免疫样本间隔三周(扩展数据图2)。每种血清对野生型和突变病毒的PRNT50同时进行了测试(扩展数据表1)。所有血清中和滴度为1:40或更高(图1)。几何平均中和滴度平均针对野生型,B.1.525 Spike,B.1.617.1尖峰,B.1.617.2 Spike,B.1.617.2-V2-Spike和B.1.618 Spike病毒是502,320,320,320,320,157,157,355,355,343和3331,图。结果表明,除B.1.617.1变体外,所有变体的中和化仅相对于野生型病毒的中和而均降低。尽管B.1.617.1的中和降低了更大的降低,但BNT162B2免疫血清有效中和B.1.617.1病毒和所有其他病毒。

  为了响应Covid-19的全球大流行,科学界增加了监视,以鉴定循环SARS-COV-2菌株中可能提高感染性,增强致病性或改变治疗剂或疫苗覆盖范围的突变。这些信息对于指导公共政策和对策的发展至关重要。As part of ongoing diligence on coverage of variants by the BNT162b2 vaccine, we have engineered variant spike genes into the backbone of the USA-WA1/2020 isolate, and, using the gold standard PRNT50 assay, tested neutralization of the resulting viruses by a panel of BTN162b2-immunized human sera drawn two or four weeks after the second of two doses ofBNT162B2给了三个星期4,5。在所有测试的病毒中,患有B.1.3514和B.1.617.1(这项研究)的尖峰蛋白的患者表现出中和表现出prnt50值分别为0.36次和0.31次,分别为0.36次和0.31次。同样,最近的一项研究发现,BNT162B2诱导的免疫血清中和临床B.1.617.1分离株,其血清中和滴度的0.14倍于野生型病毒22。其他研究发现,BNT162B2诱导的免疫血清具有0.25至0.35倍的抑制性滴定剂对具有B.1.617.1尖峰的假病毒的抑制性滴定与野生型尖峰型伪病毒相比,与野生型峰值病毒相比,BNT162B2诱导的SPSEA抑制了pSSERAINS的psseawlip,并与bnt162b诱导的psSea抑制作用。抑制滴度对野生型尖峰假病毒20。我们的结果表明,在印度最初鉴定的四个测试变体中,B.1.617.1是最低中和的,这可能是由于在受体结合位点存在L452R和E484Q取代(在受体结合位点上都存在L452R和E484Q取代(在抗体中和抗体中和抗体抗性的阳性选择下有可能在阳性下选择)1,14,14,24。尽管如此, 所有变体仍被所有测试的血清至少在40的滴度中中和。中和的降低可能是突变介导的抗体结合和改变突变的尖峰功能的逃逸的综合效应。

  最近接受两次BNT162B2剂量的参与者的一项现实研究表明,对任何记录的感染的有效性为75%,与有记录的严重,危险或致命疾病有关的有效性为100%,这是由变异B.1.35125引起的,这表明中和滴度在中和滴度的降低相似至B.1.617.1.617.1.1.617.1。与Bnt162b2诱导的血清中的B.1.617.2变体中和中和的适度减少一致,此处报道了一项在英国进行的一项测试阴性病例对照研究,发现Bnt162b2对B.1.617.2 Virus的实际有效性与B.1.617.2 virus的效率仅减少了87%。B.1.1.7谱系病毒26。因此,诸如此处观察到的中和的减少尚未被证明会导致疫苗对疾病的疗效丧失。BNT162B2不仅引起中和抗体,还引起尖峰特异性的CD4+和CD8+ T细胞以及非中和抗体依赖性细胞毒性,也可以用作免疫效应27,28。由于中和滴度并未衡量所有潜在的保护疫苗反应,因此它们不能代替疫苗功效的研究以及Covid-19-19疫苗对变体的现实有效性。

  当前研究的局限性是突变通过影响峰值功能而不是抗原性改变中和的潜力,即使变体病毒表现出与原始的USA-WA1/2020分离株相似的传染性滴度和特定的感染性。此外,我们仅检查了突变在峰值糖蛋白中的作用。尖峰基因以外的突变也可能影响病毒复制和宿主免疫反应。我们也没有检查针对变异病毒的中和滴度的耐用性。

  随着大流行的持续存在,新的变体将继续出现。迄今为止,尚无证据表明病毒变体逃脱了BNT162B2介导的COVID-19。因此,增加了通过当前安全有效的授权疫苗免疫的人口的比例仍然是最大程度地减少新变体并结束Covid-19-19-19-大流行的关键策略。

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