进行了两个大规模的酵母两杂交筛选，以鉴定从酿酒酵母基因组序列预测的全长开放阅读框之间的蛋白质 - 蛋白质相互作用。在一种方法中，我们构建了一个约6,000个酵母转化体的蛋白质阵列，每个变换剂表达一个开放式阅读帧之一，作为与激活结构域的融合。该阵列是通过192个酵母蛋白的简单且自动化的过程筛选的，其正面响应由它们在数组中的位置确定。在第二种方法中，我们汇总了表达大约6,000个激活域融合中的一个单元格，以生成库。我们使用高通量筛选程序来筛选几乎所有预测的酵母蛋白中的所有，以GAL4 DNA结合结构域融合蛋白表示，并针对文库进行筛选，并通过序列分析表征了阳性。这些方法导致检测到957个涉及1,004 S.酿酒酵母蛋白的推定相互作用。这些数据揭示了将功能上未分类的蛋白质置于生物学环境中，涉及相同生物学功能的蛋白质之间的相互作用以及将生物学功能共同将生物学功能连接到较大细胞过程的相互作用的相互作用。这些屏幕的结果在此处显示。
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