肠道菌群菌株丰富度是特定物种的，会影响植入_生活

　　A，K-MER重叠是针对从两个无关个体（紫色）培养的物种的所有成对组合计算的，而它们之间没有直接的微生物转移，或者是从单个时间点（绿色）中的个人微生物之间的直接微生物转移。虚线显示了0.96 k-mer相似性的阈值。B，对于同一物种的分离株，FastAni与成对的K-MER重叠。虚线表示K-MER重叠阈值0.96（K-MER距离<0.04）。C，在本研究中的个体和Zhao等人的研究中比较脆弱的srij。D，使用从广泛管道中分离的基因组对SRJ进行初步计算（用于创建培养的肠道细菌库的标准管道）。为了对SRJ进行更深入的采样估计，我们从E中分离了来自E的同一物种的其他基因组，原始的人粪样品和F，来自Gnotobirotic小鼠的小鼠粪便样品，用相同的人粪静脉吻合（N = 2-3只小鼠每微生物群/饮食组合），并给予富含过滤的独特饮食。D – F中的错误条表示SEM。用来自宽管道或宽管道的基因组以及G，人粪样品或H，人和小鼠粪便样品的其他基因组计算的SRJ的比较。I – L，用于验证物种的稀疏曲线。虚线显示了每个物种的平均分离株/物种（数据集的总平均分离株/物种为4.7个分离株，如图1B所示）。M，N，土壤物种（M）和湖泊物种（N）的稀疏曲线。** P <0.01，配对的Wilcoxon检验，每个点代表从健康或疾病状态的微生物中测量的平均SRJ。NS：通过配对的Wilcoxon测试不显着。稀疏曲线上的灰色区域表示95％的置信区间。

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