激活变性淋巴瘤激酶受体的机制

2025-06-23 18:39来源:本站

  A,人类ALK和LTK受体领域组织的示意图(左图)。ALK和LTK ECRS(右图)的序列比对。根据这项工作中确定的ALK-ECRABR结构,显示了二级结构图。Cys残留物是红色的,并显示了红线的二硫键。参与碱性结合的残留物为彩色洋红色,参与二聚体间二聚化的残留物是下划线的和有色的蓝色(与TNF样的接触)和灰色(与THB的接触)。The key residues involved in ALKAL2 binding are conserved between ALK and LTK (highlighted with magenta in LTK sequence), with the exception of F143, S260, L361, Q362, A365, T367, E374, R376, D388, Q390 and L401 (LTK numbering, underlined with black lines).H120/Y99和D124/E103取代(分别为Alkal2/1)和/或或/或差异可以解释碱2/1特异性的差异。B,Sec-Mals(上图)分析碱2AD,在67μm(红色),11μm(蓝色)和1μm(洋红色)的洗脱浓度下进行洗脱浓度。包括在线MALS(左轴)确定的KDA中的分子质量。碱2-AD(下图)的SV – AUC曲线。所使用的浓度为:233.53(紫色),111.25(蓝色)和55.62 µm(青色)。C,1H-15N –相关(左图)和1H-13C相关(右图)碱2AD的NMR光谱。D,20个最低能量构象体的NMR合奏。E,碱2-AD的静电表面表示。静电电势在EV中测量,如相应的颜色棒(从-5.000到+5.000 eV)所示。F,20个最低能量构象体的NMR合奏。MBP – Alkal2(C66Y)(左图)的G,SV – AUC轮廓和沉积系数C(S)C(s)。使用的浓度为:96.9 µm(紫色),48.5 µm(蓝色),29.4 µm(青色),12.1 µm(绿色),6.9 µm(黄色),3.5 µm(橙色)和1.7 µm(红色)(红色)。MBP – Alkal2(C66Y)的信号 - 重量平均S值(SW)的等温线在稀释系列(右图)中通过C(s)分布在2.5和5 s的S-range(s)分布中获得的等温线。拟合的置信区间显示在下面板中。H,碱2(左图)和碱(右图)的NMR分解和Alphafold预测结构的叠加。AD和可变区域(VR)区域被标记。i,Alk-Ecrabr – Alkal2-AD的SV – AUC轮廓。所使用的浓度为:177.8(紫色),87.87(蓝色),43.93(青色),20.92(绿色),10.46(黄色),5.44(橙色)和2.72 µm(红色)。J,SV – AUC轮廓和沉积系数分布MBP – Alkal1的模型C(S)。显示了最高(96.6 µm-紫色)和最低(4.8 µm - -Orange)浓度。k,sec – mals曲线的ALK-ECRABR-MBP-ALKAL1复合物(蓝色,理论质量为91 kDa,1:1复合体)。包括ALK-ECRABR-MBP – Alkal2(C66Y)复合物(红色,189 kDa的理论质量为2:2复合体)的曲线以进行直接比较。L,Alk-Ecrabr – Mbp-Alkal1(加载浓度74 µm)的沉积速度分析性超速离心曲线。

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