使用LDlink 4.129计算了连锁不平衡，并使用Tabix30（HTSLIB 1.10）将等位基因与古老基因组8,9,10,11进行了比较。如所述，从1000个基因组Project22的第3阶段释放构建了单倍型。使用Hasegawa-Kishino – Yano-8532替代模型，用PHYML 3.331估算系统发育，并具有γ形参数和从数据估计的不变位点的比例。如前所述，计算出特定长度或更长长度的单倍型的概率如前所述14。当今人类之间可变位置的推断祖先状态取自Ensembl33。通过过滤诊断性尼安德特人的变体（在三个高覆盖的尼安德特人基因组中的固定位置，使用108 Yoruba个体中缺少的尼安德尔等位基因丢失），使用neanderthalthal变体（在108个Yoruba个体中缺少尼安德尔人的固定位置）来计算尼安德特人单倍型的频率差异分布，并使用公开的Intogression Map20使用pluns pluns pluning pluning pluns in lind4（run）。1000个基因组项目中的变体和等位基因频率评估。使用Mathematica 11.0（Wolfram Research）和OpenStreetMap数据进行了显示等位基因频率和连锁不平衡的地图。

　　对于COVID-19-19S宿主遗传学Initiative2进行的荟萃分析，获得了参与者的同意和道德批准（https://www.covid19hg.org/partners/）。以下八项研究促进了对住院与人口对照的荟萃分析：与COVID-19相关疾病“ Belcovid”（比利时）的遗传修饰剂（Belcovid）（比利时），巴西人人口“ Bracovid”（Bracovid'ixecode odecode nifins finnection，finn finn finne contressiande copere）（芬兰芬兰分子医学研究所），Gen-Covid（意大利锡耶纳大学），Genes＆Health（英国玛丽玛丽大学，英国玛丽玛丽大学），Covid-19-Host（年龄）（Kiel University和Oslo University of Oslo和Schleswig-Holstein的医院，德国和挪威）以及UK Biobank（UK）。

　　有关研究设计的更多信息可在与本文有关的自然研究报告摘要中获得。