2025-06-22 13:53来源:本站
此处介绍的EVA已部署在2020年8月6日至11月1日的所有40点进入希腊的40点。补充图7提供了EVA架构和数据流的更详细的示意图。
接下来,我们描述处理乘客的主要步骤。
所有旅行者必须在抵达前24小时填写乘客定位表格(PLF;每个家庭一个),其中包含(除其他数据)有关其起源国家,人口统计以及进入点和日期的信息。参考。10描述了确切的字段以及如何安全地处理这些敏感数据。
我们使用以前的旅行者通过EVA的最近测试结果估算了Traveller特异性的Covid-19患病率。患病率估计需要两个步骤。首先,我们利用从高维统计的拉索(绝对绝对收缩和选择运算符)回归,根据其人口统计学特征(国家,地区,年龄和性别)适应最小的离散,可解释的旅行者类型的最低限度的离散旅行者类型;这些类型每周使用最近的测试结果进行更新。其次,我们使用经验贝叶斯方法每天估计每种类型的患病率。以前,经验贝叶斯已被用于流行病学的文献体系中,以估计许多人群的流行12,13。在我们的环境中,COVID-19的患病率通常很低(例如,〜2中有1,000分之2),并且在各国的到达率基本差异。这些功能结合在一起,导致我们的测试数据既失衡(在经过测试的情况下很少)又稀疏(一些来自某些国家的到达)。我们的经验贝叶斯方法无缝处理这两个挑战。估计细节在补充方法2.2中提供。
EVA利用这些患病率估计值,仅基于其类型而针对(组)PCR测试的一部分,但没有其他个人信息。希腊国家共同19号专家委员会批准了五组,但由于对测试准确性的担忧而避免了较大的小组,但避开了较大的小组和快速测试。
EVA的目标必须尊重反映希腊测试供应链的各种港口级预算和资源限制,其中包括400名卫生工作者,配备40个入境点,全国32个实验室以及生物样品的交付物流。这些限制(外源)在整个夏季被公共卫生总秘书处定义和调整。
测试分配决策完全是算法,平衡了两个目标。首先,鉴于当前的信息,EVA试图最大程度地提高被识别的无症状旅行者的数量(剥削)。其次,EVA从战略上分配了一些测试,为旅行者类型目前没有精确的估计来更好地学习其患病率(探索)。这是一个至关重要的反馈步骤。今天的分配将在确定未来流行率估计值时,将在上面的流行估计步骤中确定可用数据。因此,如果EVA简单地(贪婪)试图将测试分配给当前患有较高患病率的类型,那么几天后,它将不会有任何有关许多其他类型的中等流行率的测试数据。由于Covid-19的患病率可能会迅速而出乎意料地飙升,因此这将为算法留下一个“盲点”,并带来严重的公共卫生风险。这样的分配问题可以被提出为多臂匪徒15,16,17,18,这是在有关强化学习的文献中广泛研究的,并且已在许多应用程序中使用,例如移动健康19,临床试验设计20,在线广告21和推荐人系统22。
我们的应用程序是一个非组织23,24,Contextual25,批量的强盗问题,带有延迟反馈26,27和Constraints28。尽管这些功能已被孤立地研究,但它们的结合和实际实施却带来了独特的挑战。一个这样的挑战是考虑“管道”测试的信息(分配了尚未返回结果的测试);我们介绍了一种新颖的算法,具有确定性等效更新的新算法技术,以使我们期望从这些测试中获得的模型信息,从而使我们能够有效地平衡非机构,批处理设置的探索和剥削。为了提高可解释性,我们基于多臂Bandits29的乐观Gittins指数;每种类型都与代表其当前“风险评分”的确定性指数相关联,既包含其估计的患病率和不确定性。补充方法2.3中提供了算法详细信息。
EVA的流行率估计还用于推荐特别有风险的国家,以与希腊的Covid-19工作队和政府总统合作。Grey-listing a country entails a tradeoff: requiring a PCR test reduces the prevalence among incoming travellers, but it also reduces non-essential travel significantly (approximately 39%; Supplementary Methods 5), because of the relative difficulty/expense in obtaining PCR tests in summer 2020. Hence, Eva recommends grey-listing a country only when necessary to keep the daily flow of (uncaught) infected travellers at a足够低的水平避免了压倒性的接触追踪团队30。在2020年夏天,十个国家 /地区被列入灰色(补充方法5)。
与测试决策不同,我们的灰色上市决策不是完全算法,而是涉及人类的意见。实际上,虽然从理论上讲,人们可能会确定灰色上列的“最佳”截止,以平衡感染的到达和减少旅行,但实际上很难直接从决策者那里引起这种偏好。相反,他们宁愿保留一些灵活性,以在决策中考虑其他因素。
根据测试分配步骤执行的测试结果在24-48 h内记录,然后用于更新上一步的患病率估计。
为了给人一种规模的感觉,在高峰季节(8月和9月),EVA每天处理41,830(±12,784)PLF,每天测试到达家庭的16.7%(±4.8%)。