我们感谢Levy和Thaiss Laboratories的讨论和意见。我们承认宾夕法尼亚大学分子病理学和成像核心，医学系，胃肠病学系和CDB显微镜核心设施，用于处理和成像组织样品；S. Offermans，M。V。Kumar和N. Singh提供老鼠；Shalem实验室（CHOP）可帮助细胞分类；E. Krespan和D. Beiting（Upenn）与RNA-Seq一起支持；P. W. Czyzewicz（Fox Chase Cancer Center）为动物实验提供帮助；X. Wang和A. Blanco（Upenn）寻求CRISPR实验的帮助；J. Schug和PSOM下一代测序核心，以帮助亚硫酸盐测序分析；E. Friedman以及Pennchop微生物组计划的微生物培养和代谢组学核心；以及消化和肝病分子研究中心的宿主微生物分析和存储库核心（P30DK050306）。人体器官支持来自费城儿童医院胃肠道上皮建模计划。我们感谢J. H.-M。和S. Cherry寻求建议。J.A.E.由NIH Grant R35-HL-140018支持。R.J.由NIH Grant R01-HL-139783和Burroughs Wellcome基金提供支持。A.C.W.由培训授予T32 -AI -055400-19的支持。P.L.由培训赠款T32-AI-141393支持。S.I.G.由NIH赠款R01-CA-218133，R01-CA-227629和P30-CA-006927以及BSF US-ISRAEL基金会提供支持。J.K.由Boehringer Ingelheim Fonds MD奖学金支持。K.M.S.由DFG奖学金DFG Schn 1626/1-1支持。猫。是一名皮尤生物医学学者和Kathryn W. Davis老龄脑学者，并得到NIH导演的新创新者奖（DP2-AG-067492），Agilent早期职业教授奖和Edsa Mallinckrodt JR基金会，IDSA基金会，THYSSEN FORINTITS，PENNCHOP MICROBIOME，PENNCHOME MICROBIOME，PENNCHOME MICTOMOME，PENNCHOME， 宾夕法尼亚州消化和肝病分子研究中心（P30-DK-050306），宾夕法尼亚州皮肤生物学和疾病基于资源的基于资源的中心（P30-AR-069589），Penn糖尿病研究中心（P30-DK-019525）和宾夕法尼亚州的宾夕法尼亚大学。M.L.由NIH董事的新创新者奖（DP2-AG-067511），美国癌症学者奖，Searle Scholar计划，Edward Mallinckrodt JR基金会和宾夕法尼亚州宾夕法尼亚州宾夕法尼亚州宾夕法尼亚州免疫学研究所的宾夕法尼亚学院和宾夕法尼亚州宾夕法尼亚州分子研究中心的宾夕法尼亚学院的宾夕法尼亚学院宾夕法尼亚州宾夕法尼亚州宾夕法尼亚州宾夕法尼亚州宾夕法尼亚州宾夕法尼亚州宾夕法尼亚州宾夕法尼亚州宾夕法尼亚学院的赠款的赠款，宾夕法尼亚州宾夕法尼亚州精确的精确，环境毒理学（P30-ES-013508）和Lynch综合征的Borrelli家庭飞行员补助金。