沿酶促反应轨迹的内在运动_科技快讯

　　长期以来，酶达到特定速率加速度和特异性的机制在生物化学中一直具有关键感兴趣。人们普遍认为，底物结合与底物 - 酶复合物的构象变化耦合，可以在最佳的有效化学环境中对齐反应性基团。尽管已经为许多酶阐明了化学机制，但酶如何实现催化能力的状态的问题直到最近才通过实验和计算变得可实现。在这里，我们显示了沿轨迹的构象取代的晶体学证据，该轨迹以无配体腺苷酸激酶的无配体形式的催化竞争能力的“封闭”状态。分子动力学模拟表明，这些部分闭合的构象在纳米秒中采样，而核磁共振和单分子荧光共振能传递揭示了在微秒到毫秒到毫秒的时间表上发生完全闭合构象的罕见采样。因此，无底物腺苷酸激酶中的大规模运动不是随机的，而是优先遵循创造能够熟练化学的构型的途径。这种首选的方向性（用折叠中编码）可能有助于许多酶的催化。

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